Filmowa "Pestka" jest adaptacją popularnej w latach 60. powieści Anki Kowalskiej pod tym samym tytułem.
Film opowiada historię Agaty (Krystyna Janda), dojrzałej i niezależnej kobiety, autorki wierszy, która mimo wielu prób wciąż czeka i jest otwarta na spotkanie z miłością życia. Na ślubie przyjaciółki poznaje Borysa (Daniel Olbrychski), architekta, męża i ojca. Znajomość przeradza się w namiętność. W tym związku kochanków, największa wartością dla Agaty jest miłość. I mimo, że nie myśli ona o formalnym związku z Borysem, ten postanawia porzucić swoja rodzinę. Krok ten niesie za sobą szereg wydarzeń i komplikacji, które szczególnie boleśnie dotkną właśnie Agatę.